Пустынь Святого Духа Утешителя – иное название: скит Параклит (греч. Параклит – «Утешитель», так называется Третье Лицо Пресвятой Троицы, Дух Святой, в Священном Писании). Основана в 1858 г. близ Гефсиманского скита Лавры попечением ее наместника преп. Антония Радонежского. В январе 1929 г. скит был закрыт. В настоящее время возрождается как подворье Троице-Сергиевой Лавры.
Пустынь была создана на месте древнего Свято-Николького монастыря. Землю под новую пустынь пожаловал Лавре Александр II по случаю рождения в 1857 году великого князя Сергея Александровича.
В 1861 году выстроено старейшее из сохранившихся зданий скита — церковь, построенная на средства московского купца Королева, двухэтажная, с престолом в честь Сошествия Святаго Духа в верхнем этаже и с престолом в память обретения главы Иоанна Предтечи в нижнем этаже (архитектор — П. Миронов; по другим сведениям — И. Малышев).
В конце XIX — начале XX веков в духе псевдорусского стиля выстроены кирпичная ограда (не сохранилась), самое высокое сооружение монастыря — кирпичная надвратная колокольня (1896—1898 гг., архитектор — А.А. Латков), несколько корпусов; храм был расширен пристройками.
После закрытия Троице-Сергиевой лавры (1919 г.) скит Параклит некоторое время действовал как самостоятельный монастырь (официально значился как трудовая артель). В 1924 году в пустыни принял постриг будущий Патриарх Московский и Всея Руси Пимен (Извеков). В 1929 году пустынь упразднена. До середины 1960-х годов в храме Святого Духа Параклита размещался сельский клуб.
Пустынь возвращена РПЦ в 1992 году.